Για τον κιμά :
Σε μια κατσαρόλα προσθέτουμε ελαιόλαδο , το κρεμμύδι, θυμάρι και σοτάρουμε .
Βάζουμε το γαρύφαλλο, το μοσχοκάρυδο , τη κανέλλα , τις πιπεριές , αλάτι πιπέρι και ανακατεύουμε μέχρι να σοταριστούν καλά .Έπειτα προσθέτουμε τον κιμά κοτόπουλο .
Ανακατεύουμε καλά και βάζουμε το σκόρδο, τις ντομάτες και τον κύβο λαχανικών αραιωμένο σε νερό . Αφήνουμε μέχρι να γίνει .

Για τη μπεσαμέλ :
Σε ένα μπολάκι βάζουμε το γιαούρτι με πιπέρι , μπούκοβο , το αυγό και τον κρόκο και ανακατεύουμε πολύ καλά . Έπειτα προσθέτουμε τα 20 γρ τριμμένη μυζήθρα και ανακατεύουμε .

Σε ένα ταψάκι βάζουμε τις βρασμένες πένες ολικής , τον κιμά , τη μπεσαμέλ και στρώνουμε .
Ρίχνουμε την υπόλοιπη μυζήθρα και ψήνουμε σε προθερμασμένο φούρνο στους 180 βαθμούς μέχρι να πάρει ωραίο χρώμα .